Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDB1Q16531 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDB1Q16531 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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