Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS72Q15906 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
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