Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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