Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms