Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3CQ15386 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms