Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTCH1Q13635 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
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