Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC1Q13547 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
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