Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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