Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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