Protein–RNA interactions for Protein: Q13395

TARBP1, Probable methyltransferase TARBP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1Q13395 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TARBP1Q13395 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TARBP1Q13395 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TARBP1Q13395 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
TARBP1Q13395 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
TARBP1Q13395 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
TARBP1Q13395 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TARBP1Q13395 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TARBP1Q13395 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
TARBP1Q13395 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TARBP1Q13395 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
TARBP1Q13395 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TARBP1Q13395 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TARBP1Q13395 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TARBP1Q13395 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TARBP1Q13395 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TARBP1Q13395 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TARBP1Q13395 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TARBP1Q13395 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TARBP1Q13395 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TARBP1Q13395 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TARBP1Q13395 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TARBP1Q13395 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TARBP1Q13395 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TARBP1Q13395 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms