Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SREBF2Q12772 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SREBF2Q12772 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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