Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSME1Q06323 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms