Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNGA1P29973 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGA1P29973 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms