Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms