Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRB1P17538 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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