Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMC1P11047 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms