Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABARAPO95166 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms