Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASKO14936 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASKO14936 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASKO14936 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASKO14936 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASKO14936 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASKO14936 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASKO14936 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASKO14936 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASKO14936 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASKO14936 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASKO14936 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASKO14936 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASKO14936 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASKO14936 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASKO14936 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CASKO14936 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASKO14936 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASKO14936 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASKO14936 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASKO14936 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASKO14936 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASKO14936 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASKO14936 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASKO14936 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASKO14936 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASKO14936 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASKO14936 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASKO14936 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASKO14936 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASKO14936 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASKO14936 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASKO14936 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASKO14936 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASKO14936 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASKO14936 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASKO14936 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASKO14936 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASKO14936 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms