Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RRN3Q9NYV6 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RRN3Q9NYV6 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.63□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RRN3Q9NYV6 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RRN3Q9NYV6 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RRN3Q9NYV6 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.9 ms