Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-2.28□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
LAMA3Q16787 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-2.32□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-2.33□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC-2.33□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
LAMA3Q16787 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-2.35□□□□□ -2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.5 ms