Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CHAF1BQ13112 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.75□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CHAF1BQ13112 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CHAF1BQ13112 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CHAF1BQ13112 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
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