Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-4.97□□□□□ -3.2
CENPFP49454 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-4.97□□□□□ -3.2
CENPFP49454 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-4.97□□□□□ -3.21
CENPFP49454 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-4.97□□□□□ -3.21
CENPFP49454 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC-4.98□□□□□ -3.21
CENPFP49454 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-4.98□□□□□ -3.21
CENPFP49454 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-4.98□□□□□ -3.21
CENPFP49454 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC-4.99□□□□□ -3.21
CENPFP49454 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-4.99□□□□□ -3.21
CENPFP49454 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-4.99□□□□□ -3.21
CENPFP49454 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-4.99□□□□□ -3.21
CENPFP49454 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC-4.99□□□□□ -3.21
CENPFP49454 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-4.99□□□□□ -3.21
CENPFP49454 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC-4.99□□□□□ -3.21
CENPFP49454 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-5□□□□□ -3.21
CENPFP49454 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC-5□□□□□ -3.21
CENPFP49454 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-5□□□□□ -3.21
CENPFP49454 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
CENPFP49454 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
CENPFP49454 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
CENPFP49454 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
CENPFP49454 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
CENPFP49454 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
CENPFP49454 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
CENPFP49454 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
CENPFP49454 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
CENPFP49454 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
CENPFP49454 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
CENPFP49454 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
CENPFP49454 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
CENPFP49454 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
CENPFP49454 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
CENPFP49454 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
CENPFP49454 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC-5.03□□□□□ -3.21
CENPFP49454 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-5.03□□□□□ -3.22
CENPFP49454 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-5.03□□□□□ -3.22
CENPFP49454 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-5.03□□□□□ -3.22
CENPFP49454 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-5.04□□□□□ -3.22
CENPFP49454 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC-5.04□□□□□ -3.22
CENPFP49454 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-5.04□□□□□ -3.22
CENPFP49454 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-5.04□□□□□ -3.22
CENPFP49454 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-5.04□□□□□ -3.22
CENPFP49454 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-5.04□□□□□ -3.22
CENPFP49454 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-5.04□□□□□ -3.22
CENPFP49454 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC-5.04□□□□□ -3.22
CENPFP49454 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC-5.04□□□□□ -3.22
CENPFP49454 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
CENPFP49454 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
CENPFP49454 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
CENPFP49454 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
CENPFP49454 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
CENPFP49454 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
CENPFP49454 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
CENPFP49454 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
CENPFP49454 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
CENPFP49454 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
CENPFP49454 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
CENPFP49454 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
CENPFP49454 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
CENPFP49454 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC-5.09□□□□□ -3.22
CENPFP49454 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-5.09□□□□□ -3.22
CENPFP49454 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC-5.1□□□□□ -3.23
CENPFP49454 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC-5.1□□□□□ -3.23
CENPFP49454 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-5.1□□□□□ -3.23
CENPFP49454 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC-5.1□□□□□ -3.23
CENPFP49454 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-5.11□□□□□ -3.23
CENPFP49454 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC-5.11□□□□□ -3.23
CENPFP49454 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-5.12□□□□□ -3.23
CENPFP49454 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC-5.12□□□□□ -3.23
CENPFP49454 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC-5.12□□□□□ -3.23
CENPFP49454 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC-5.12□□□□□ -3.23
CENPFP49454 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-5.13□□□□□ -3.23
CENPFP49454 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-5.13□□□□□ -3.23
CENPFP49454 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC-5.13□□□□□ -3.23
CENPFP49454 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-5.14□□□□□ -3.23
CENPFP49454 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-5.14□□□□□ -3.23
CENPFP49454 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-5.14□□□□□ -3.23
CENPFP49454 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-5.14□□□□□ -3.23
CENPFP49454 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
CENPFP49454 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
CENPFP49454 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
CENPFP49454 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
CENPFP49454 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
CENPFP49454 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC-5.16□□□□□ -3.23
CENPFP49454 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-5.16□□□□□ -3.23
CENPFP49454 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-5.16□□□□□ -3.24
CENPFP49454 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-5.16□□□□□ -3.24
CENPFP49454 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-5.17□□□□□ -3.24
CENPFP49454 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-5.17□□□□□ -3.24
CENPFP49454 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-5.17□□□□□ -3.24
CENPFP49454 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-5.17□□□□□ -3.24
CENPFP49454 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC-5.18□□□□□ -3.24
CENPFP49454 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-5.18□□□□□ -3.24
CENPFP49454 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-5.18□□□□□ -3.24
CENPFP49454 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC-5.18□□□□□ -3.24
CENPFP49454 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-5.18□□□□□ -3.24
CENPFP49454 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-5.18□□□□□ -3.24
CENPFP49454 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-5.19□□□□□ -3.24
CENPFP49454 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-5.19□□□□□ -3.24
CENPFP49454 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-5.19□□□□□ -3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.3 ms