Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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