Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
CACNA1CQ13936 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms