Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
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KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
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KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
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KRTAP9-3Q9BYQ3 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
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KRTAP9-3Q9BYQ3 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
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KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
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KRTAP9-3Q9BYQ3 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
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KRTAP9-3Q9BYQ3 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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