Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXD1Q16676 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
FOXD1Q16676 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD1Q16676 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXD1Q16676 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXD1Q16676 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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