Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SKP2Q13309 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SKP2Q13309 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SKP2Q13309 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SKP2Q13309 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SKP2Q13309 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SKP2Q13309 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SKP2Q13309 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SKP2Q13309 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SKP2Q13309 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SKP2Q13309 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SKP2Q13309 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SKP2Q13309 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SKP2Q13309 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SKP2Q13309 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SKP2Q13309 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SKP2Q13309 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SKP2Q13309 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SKP2Q13309 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SKP2Q13309 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SKP2Q13309 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SKP2Q13309 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SKP2Q13309 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SKP2Q13309 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SKP2Q13309 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SKP2Q13309 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SKP2Q13309 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SKP2Q13309 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SKP2Q13309 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.1 ms