Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NFIAQ12857 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFIAQ12857 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NFIAQ12857 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.8 ms