Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-2.45□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CCDC115Q96NT0 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CCDC115Q96NT0 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CCDC115Q96NT0 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CCDC115Q96NT0 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CCDC115Q96NT0 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CCDC115Q96NT0 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CCDC115Q96NT0 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CCDC115Q96NT0 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CCDC115Q96NT0 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CCDC115Q96NT0 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-2.5□□□□□ -2.81
CCDC115Q96NT0 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CCDC115Q96NT0 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CCDC115Q96NT0 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CCDC115Q96NT0 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CCDC115Q96NT0 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CCDC115Q96NT0 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CCDC115Q96NT0 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CCDC115Q96NT0 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CCDC115Q96NT0 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-2.55□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CCDC115Q96NT0 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CCDC115Q96NT0 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.1 ms