Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TOP1MTQ969P6 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
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