Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CAMK2BQ13554 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CAMK2BQ13554 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CAMK2BQ13554 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CAMK2BQ13554 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CAMK2BQ13554 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CAMK2BQ13554 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CAMK2BQ13554 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CAMK2BQ13554 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CAMK2BQ13554 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
CAMK2BQ13554 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CAMK2BQ13554 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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