Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.59□□□□□ -2.82
CPSF1Q10570 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-2.65□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
CPSF1Q10570 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-2.67□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.2 ms