Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD1Q16676 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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