Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SKIV2LQ15477 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKIV2LQ15477 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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