Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KCNMA1Q12791 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KCNMA1Q12791 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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