Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
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MEIS3Q99687 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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MEIS3Q99687 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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MEIS3Q99687 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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MEIS3Q99687 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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MEIS3Q99687 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MEIS3Q99687 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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MEIS3Q99687 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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MEIS3Q99687 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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MEIS3Q99687 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
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MEIS3Q99687 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
MEIS3Q99687 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MEIS3Q99687 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MEIS3Q99687 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MEIS3Q99687 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MEIS3Q99687 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MEIS3Q99687 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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MEIS3Q99687 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MEIS3Q99687 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MEIS3Q99687 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
MEIS3Q99687 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
MEIS3Q99687 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MEIS3Q99687 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MEIS3Q99687 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MEIS3Q99687 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MEIS3Q99687 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MEIS3Q99687 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MEIS3Q99687 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MEIS3Q99687 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MEIS3Q99687 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MEIS3Q99687 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MEIS3Q99687 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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