Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRNQ16849 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRNQ16849 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRNQ16849 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRNQ16849 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRNQ16849 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRNQ16849 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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PTPRNQ16849 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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PTPRNQ16849 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRNQ16849 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
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PTPRNQ16849 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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PTPRNQ16849 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRNQ16849 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRNQ16849 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRNQ16849 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRNQ16849 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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PTPRNQ16849 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRNQ16849 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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PTPRNQ16849 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRNQ16849 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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PTPRNQ16849 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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PTPRNQ16849 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRNQ16849 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRNQ16849 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRNQ16849 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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PTPRNQ16849 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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PTPRNQ16849 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRNQ16849 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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PTPRNQ16849 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRNQ16849 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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PTPRNQ16849 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRNQ16849 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRNQ16849 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRNQ16849 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRNQ16849 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRNQ16849 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRNQ16849 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRNQ16849 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRNQ16849 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRNQ16849 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRNQ16849 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRNQ16849 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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PTPRNQ16849 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRNQ16849 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRNQ16849 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRNQ16849 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRNQ16849 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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