Protein–RNA interactions for Protein: Q13671

RIN1, Ras and Rab interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN1Q13671 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RIN1Q13671 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RIN1Q13671 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RIN1Q13671 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RIN1Q13671 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RIN1Q13671 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms