Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CLN3Q13286 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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