Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMN1Q16637 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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