Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-2.22□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SPTAN1Q13813 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-2.27□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC-2.27□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SPTAN1Q13813 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SPTAN1Q13813 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SPTAN1Q13813 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SPTAN1Q13813 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SPTAN1Q13813 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SPTAN1Q13813 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC-2.29□□□□□ -2.78
SPTAN1Q13813 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.2 ms