Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PMS2P3Q13401 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PMS2P3Q13401 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PMS2P3Q13401 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.32□□□□□ -2.62
PMS2P3Q13401 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PMS2P3Q13401 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PMS2P3Q13401 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PMS2P3Q13401 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PMS2P3Q13401 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PMS2P3Q13401 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PMS2P3Q13401 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PMS2P3Q13401 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PMS2P3Q13401 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PMS2P3Q13401 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PMS2P3Q13401 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PMS2P3Q13401 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
PMS2P3Q13401 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
PMS2P3Q13401 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PMS2P3Q13401 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PMS2P3Q13401 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PMS2P3Q13401 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PMS2P3Q13401 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PMS2P3Q13401 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-1.41□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PMS2P3Q13401 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
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