Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM32Q13049 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRIM32Q13049 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRIM32Q13049 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRIM32Q13049 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRIM32Q13049 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRIM32Q13049 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRIM32Q13049 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms