Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms