Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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HCN4Q9Y3Q4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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HCN4Q9Y3Q4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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HCN4Q9Y3Q4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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HCN4Q9Y3Q4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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HCN4Q9Y3Q4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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HCN4Q9Y3Q4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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HCN4Q9Y3Q4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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HCN4Q9Y3Q4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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HCN4Q9Y3Q4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN4Q9Y3Q4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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