Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRPS28Q9Y2Q9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms