Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
MLH3Q9UHC1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MLH3Q9UHC1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms