Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VTI1BQ9UEU0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms