Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
REREQ9P2R6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms