Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CCDC180Q9P1Z9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CCDC180Q9P1Z9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC180Q9P1Z9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms